Kaupunkieläinten maanalainen valtakunta edustaa yhtä vähiten ymmärretyistä ja monimutkaisimmista kaupunkiekosysteemien näkökohdista, paljastaen miten inhimillinen infrastruktuuri on luonut valtavia piilotettuja valtateitä ja elinympäristöjä jalkojemme alla. Tämä maanalainen maailma haastaa pintakeskeisen näkemyksemme kaupunkiekologiasta ja osoittaa kaupunkieläinten sopeutumisen kolmiulotteisen luonteen.
Metrojärjestelmien ja hulevesiviemäreiden muuttuminen eläinten käytäviksi edustaa tahatonta mutta merkittävää ekologista saavutusta. Nämä maanalaiset verkostot tarjoavat ilmastoidusti kontrollituita ympäristöjä, jotka pysyvät suhteellisen vakaina kausimuutosten aikana, tarjoten turvapaikan äärimmäisten sääolosuhteiden ja ankaran talven aikana. Tunnelit järjestelmät luovat suojattuja muuttoreittejä, jotka mahdollistavat pienten nisäkkäiden ylittää kaupunkialueita ilman altistumista pintavaaroille kuten liikenteelle, pedoille ja ihmishäiriöille. Nämä kulkutiet ovat tulleet niin olennaisiksi kaupunkieläinten liikkeelle, että jotkin lajit ovat kehittäneet käyttäytymiskuvioita, jotka on erityisesti sopeutettu maanalaiseen navigointiin.
Kaupunkeihin sopeutuneiden sammakkoeläinten läsnäolo maanalaisissa vesijärjestelmissä paljastaa näiden usein herkkien lajien merkittävän plastisuuden. Salamanterit ja sammakot, jotka ovat asuttaneet kaupunkien hulevesiviemäreitä ja metrotunneleita, ovat voittaneet merkittäviä ympäristöhaasteita, mukaan lukien muuttuneet vedenkemia, keinovalaistus ja rajalliset ravintolähteet. Nämä populaatiot usein kehittävät ainutlaatuisia ominaisuuksia, kuten muokattuja lisääntymissyklejä, jotka ovat linjassa kaupunkien vesivirtauskuvioiden kanssa ja lisääntynyttä sietokykyä kaupunkien pintavesistä yleisesti löytyville saasteille. Näiden sammakkoeläinpopulaatioiden menestys toimii kaupunkiekosysteemin terveyden indikaattorina ja osoittaa kaupunkien potentiaalin tukea yllättävän monimuotoisia eläinyhteisöjä.
Maanalaisissa kaupunkiympäristöissä kukoistavat selkärangattomien yhteisöt muodostavat monimutkaisten maanalaisten ravintoketjujen perustan. Nämä niveljalkaispopulaatiot sisältävät sekä alkuperäislajeja, jotka ovat sopeutuneet kaupunkiolosuhteisiin, että tuotuja lajeja, jotka ovat löytäneet ihanteelliset olosuhteet ihmisten muokkaamista ympäristöistä. Kaupunkien luolassa asuvat hämähäkit, kovakuoriaiset ja muut selkärangattomat saavuttavat usein populaatiotiheydet, jotka ylittävät luonnollisissa maanalaisissa ympäristöissä löydetyt, tuettuna orgaanisella aineksella, joka huuhtoutuu pintaaktiviteeteista ja vakailla ympäristöolosuhteilla. Nämä selkärangattomien yhteisöt tukevat korkeamman tason petoeläimiä ja myötävaikuttavat kaupunkien ravintokiertoon tavoilla, joita vasta aletaan ymmärtää.
Maanalaisten tilojen hyödyntäminen lintujen ja lepakoiden toimesta edustaa kiehtovaa esimerkkiä käyttäytymisen joustavuudesta kaupunkieläimistössä. Pääskyset, jotka pesivät metrotunneleissa ja parkkihalleissa, ovat muokanneet perinteistä kalliolla asumisen käyttäytymistään hyödyntääkseen inhimillistä infrastruktuuria. Nämä linnut usein kehittävät paikkauskotruetukutsumista tiettyihin maanalaisiin paikkoihin, palaten vuosi toisensa jälkeen samoihin pesimäpaikkoihin. Kaupunkien lepakot, jotka lepäävät maanalaisissa tiloissa, hyötyvät vakaista lämpötiloista ja säältä suojautumisesta samalla säilyttäen pääsyn rikkaaksi kaupunkiravinnonnoutuun maanpäällä. Jotkin lajit ovat jopa muokanneet sosiaalisia rakenteitaan, kaupunkien lepakkoyhdyskuntien usein osoittaessa erilaisia lepäämiskuvioita verrattuna maaseutulaisiin vastineihinsa.
Maanalaisten verkostojen tarjoama ekologinen yhdistettävyys ulottuu paljon yksinkertaisen eläinten liikkeen yli. Nämä järjestelmät helpottavat geneettistä vaihtoa muuten eristettyjen kaupunkieläinpopulaatioiden välillä, auttaen ylläpitämään geneettistä monimuotoisuutta ja populaation elinkykyä. Maanalaiset käytävät mahdollistavat myös nopean uudelleenasuttamisen kaupunkialueilla paikallisten sukupuuttojen jälkeen, myötävaikuttaen ekosysteemin kestävyyteen. Maanalainen ympäristö usein tukee erilaisia lajikoostumuksia kuin pintaelinympäristöt, tehokkaasti tuplaten kaupunkialueiden potentiaalisen biologisen monimuotoisuuden tarjoamalla vaihtoehtoisia ekologisia markkinarakoja.